@Test
public void addRegionsOutOfOrder() {
final String contigTwoName = header.getSequenceDictionary().getSequence(2).getSequenceName();
assertTrue(mSortedSet.size() == 0);
GenomeLoc g = genomeLocParser.createGenomeLoc(contigTwoName, 1, 50);
mSortedSet.add(g);
GenomeLoc f = genomeLocParser.createGenomeLoc(contigOneName, 30, 80);
mSortedSet.addRegion(f);
assertTrue(mSortedSet.size() == 2);
assertTrue(mSortedSet.toList().get(0).getContig().equals(contigOneName));
assertTrue(mSortedSet.toList().get(1).getContig().equals(contigTwoName));
}
