@Override
public Long countConceptsAlignedToExtThes(String idThesaurus) {
DetachedCriteria alignmentCriteria =
DetachedCriteria.forClass(Alignment.class, "al")
.add(Restrictions.isNotNull("al.externalTargetThesaurus"))
.setProjection(
Projections.projectionList()
.add(Projections.property(AL_SOURCE_CONCEPT_IDENTIFIER)));
DetachedCriteria conceptCriteria =
DetachedCriteria.forClass(ThesaurusConcept.class, "stc")
.add(Restrictions.eq("stc.thesaurus.identifier", idThesaurus))
.setProjection(
Projections.projectionList().add(Projections.property("stc.identifier")));
Criteria criteria =
getCurrentSession()
.createCriteria(ThesaurusConcept.class, "tc")
.add(
Restrictions.and(
Subqueries.propertyIn(TC_IDENTIFIER, alignmentCriteria),
Subqueries.propertyIn(TC_IDENTIFIER, conceptCriteria)))
.setProjection(Projections.rowCount());
return (Long) criteria.list().get(0);
}
@SuppressWarnings("unchecked") // Hibernate
public List<GeometryEntity> getGeometriesOrderedByTimestamp(DbQuery parameters) {
Criteria criteria = session.createCriteria(SamplingGeometryEntity.class);
DetachedCriteria filter = parameters.createDetachedFilterCriteria("pkid");
criteria.add(Subqueries.propertyIn(COLUMN_SERIES_PKID, filter));
criteria.setResultTransformer(Criteria.DISTINCT_ROOT_ENTITY);
criteria.addOrder(Order.asc(COLUMN_TIMESTAMP));
parameters.addSpatialFilterTo(criteria, parameters);
return (List<GeometryEntity>) criteria.list();
}
/**
* Convenience method that adds an expression to the given <code>criteria</code> according to what
* types of person objects is wanted
*
* @param criteria
* @param personType
* @return the given criteria (for chaining)
*/
private Criteria getCriteriaPersonModifier(Criteria criteria, List<PERSON_TYPE> personTypes) {
if (personTypes.contains(PERSON_TYPE.PATIENT)) {
DetachedCriteria crit =
DetachedCriteria.forClass(Patient.class, "patient")
.setProjection(Property.forName("patientId"));
criteria.add(Subqueries.propertyIn("person.personId", crit));
}
if (personTypes.contains(PERSON_TYPE.USER)) {
DetachedCriteria crit =
DetachedCriteria.forClass(User.class, "user").setProjection(Property.forName("userId"));
criteria.add(Subqueries.propertyIn("person.personId", crit));
}
if (personTypes.contains(PERSON_TYPE.PERSON)) {
// all observations are already on person's. Limit to non-patient and non-users here?
// criteria.createAlias("Person", "person");
// criteria.add(Restrictions.eqProperty("obs.person.personId", "person.personId"));
}
return criteria;
}
public PaginatedList<Keyword> findKeywords(
Keyword keyword,
final boolean ignoreCase,
final Order order,
final Integer firstResult,
final Integer maxResults)
throws IllegalArgumentException {
if (keyword == null) {
throw new IllegalArgumentException("keyword cannot be null");
}
final MatchMode matchMode = MatchMode.ANYWHERE;
Example criterionKeyword = Example.create(keyword);
criterionKeyword.enableLike(matchMode);
if (ignoreCase) {
criterionKeyword.ignoreCase();
}
// Normally, Hibernate performs a left-outer join, when searching for
// an object with collections using Criteria. This returns a ResultSet
// that contains duplicate objects. In order to get a unique list of
// Keywords with paginated support, we need to a nested query to find
// distinct matching ids, then get the Keywords. The end result is a
// subselect in the main query, but only one query is sent.
DetachedCriteria dc = DetachedCriteria.forClass(Keyword.class);
dc.add(criterionKeyword);
dc.setResultTransformer(DISTINCT_ROOT_ENTITY);
Conjunction conjunction =
createTranslationConditions(keyword.getTranslations(), ignoreCase, matchMode);
if (conjunction != null) dc.createCriteria(FIELD_TRANSLATIONS).add(conjunction);
dc.setProjection(Projections.id());
Criteria criteria = getSession().createCriteria(Keyword.class);
criteria.add(Subqueries.propertyIn(FIELD_ID, dc));
if (Order.desc == order) criteria.addOrder(desc(FIELD_KEYWORD));
else criteria.addOrder(asc(FIELD_KEYWORD));
if (firstResult != null) criteria.setFirstResult(firstResult);
if (maxResults != null) criteria.setMaxResults(maxResults);
final List<Keyword> criteriaList = criteria.list();
int maxListSize = 0;
if (criteriaList.size() > 0) {
maxListSize = calculateMaxListSize(criterionKeyword, conjunction);
}
return new PaginatedList<Keyword>(criteriaList, maxListSize);
}
@Override
public List<Salon> getByEquipoName(String equipoName) {
Criterion crit1 = Restrictions.ilike("name", equipoName, MatchMode.ANYWHERE);
DetachedCriteria subQuery =
DetachedCriteria.forClass(Salon.class)
.createCriteria("equipos")
.add(Restrictions.or(crit1))
.setProjection(Projections.id());
Criteria mainCriteria =
getSession()
.createCriteria(Salon.class)
.add(Subqueries.propertyIn("id", subQuery))
.setFetchMode("equipos", FetchMode.JOIN);
return mainCriteria.list();
}
@Override
public List<ThesaurusConcept> getConceptsAlignedToMyThes(
String idThesaurus, int startIndex, int limit) {
DetachedCriteria alignmentCriteria =
DetachedCriteria.forClass(Alignment.class, "al")
.add(Restrictions.eq("al.internalTargetThesaurus.identifier", idThesaurus))
.setProjection(
Projections.projectionList()
.add(Projections.property(AL_SOURCE_CONCEPT_IDENTIFIER)));
Criteria criteria =
getCurrentSession()
.createCriteria(ThesaurusConcept.class, "tc")
.add(Subqueries.propertyIn(TC_IDENTIFIER, alignmentCriteria))
.setFirstResult(startIndex)
.setMaxResults(limit);
return (List<ThesaurusConcept>) criteria.list();
}
public List<RecepcionMx> getRecepcionesByFiltro(FiltroMx filtro) {
Session session = sessionFactory.getCurrentSession();
Soundex varSoundex = new Soundex();
Criteria crit = session.createCriteria(RecepcionMx.class, "recepcion");
crit.createAlias("recepcion.tomaMx", "tomaMx");
crit.createAlias("tomaMx.estadoMx", "estado");
// crit.createAlias("orden.idTomaMx", "tomaMx");
crit.createAlias("tomaMx.idNotificacion", "notifi");
// siempre se tomam las muestras que no estan anuladas
crit.add(
Restrictions.and(
Restrictions.eq("tomaMx.anulada", false))); // y las ordenes en estado según filtro
if (filtro.getCodEstado() != null) {
if (filtro.getIncluirTraslados()) {
crit.add(
Restrictions.or(Restrictions.eq("estado.codigo", filtro.getCodEstado()).ignoreCase())
.add(Restrictions.or(Restrictions.eq("estado.codigo", "ESTDMX|TRAS"))));
} else {
crit.add(
Restrictions.and(
Restrictions.eq("estado.codigo", filtro.getCodEstado().toLowerCase())
.ignoreCase()));
}
}
// se filtra por nombre y apellido persona
if (filtro.getNombreApellido() != null) {
// crit.createAlias("notifi.persona", "person");
String[] partes = filtro.getNombreApellido().split(" ");
String[] partesSnd = filtro.getNombreApellido().split(" ");
for (int i = 0; i < partes.length; i++) {
try {
partesSnd[i] = varSoundex.encode(partes[i]);
} catch (IllegalArgumentException e) {
partesSnd[i] = "0000";
e.printStackTrace();
}
}
for (int i = 0; i < partes.length; i++) {
Junction conditGroup = Restrictions.disjunction();
conditGroup
.add(
Subqueries.propertyIn(
"notifi.persona.personaId",
DetachedCriteria.forClass(SisPersona.class, "person")
.add(
Restrictions.or(
Restrictions.ilike(
"person.primerNombre", "%" + partes[i] + "%"))
.add(
Restrictions.or(
Restrictions.ilike(
"person.primerApellido", "%" + partes[i] + "%"))
.add(
Restrictions.or(
Restrictions.ilike(
"person.segundoNombre",
"%" + partes[i] + "%"))
.add(
Restrictions.or(
Restrictions.ilike(
"person.segundoApellido",
"%" + partes[i] + "%"))
.add(
Restrictions.or(
Restrictions.ilike(
"person.sndNombre",
"%" + partesSnd[i] + "%")))))))
.setProjection(Property.forName("personaId"))))
.add(
Subqueries.propertyIn(
"notifi.solicitante.idSolicitante",
DetachedCriteria.forClass(Solicitante.class, "solicitante")
.add(Restrictions.ilike("solicitante.nombre", "%" + partes[i] + "%"))
.setProjection(Property.forName("idSolicitante"))));
crit.add(conditGroup);
}
}
// se filtra por SILAIS
if (filtro.getCodSilais() != null) {
crit.createAlias("notifi.codSilaisAtencion", "silais");
crit.add(
Restrictions.and(Restrictions.eq("silais.codigo", Long.valueOf(filtro.getCodSilais()))));
}
// se filtra por unidad de salud
if (filtro.getCodUnidadSalud() != null) {
crit.createAlias("notifi.codUnidadAtencion", "unidadS");
crit.add(
Restrictions.and(
Restrictions.eq("unidadS.codigo", Long.valueOf(filtro.getCodUnidadSalud()))));
}
// Se filtra por rango de fecha de toma de muestra
if (filtro.getFechaInicioTomaMx() != null && filtro.getFechaFinTomaMx() != null) {
crit.add(
Restrictions.and(
Restrictions.between(
"tomaMx.fechaHTomaMx",
filtro.getFechaInicioTomaMx(),
filtro.getFechaFinTomaMx())));
}
// Se filtra por rango de fecha de recepción
if (filtro.getFechaInicioRecep() != null && filtro.getFechaFinRecep() != null) {
crit.add(
Restrictions.and(
Restrictions.between(
"recepcion.fechaHoraRecepcion",
filtro.getFechaInicioRecep(),
filtro.getFechaFinRecep())));
}
// se filtra por tipo de muestra
if (filtro.getCodTipoMx() != null) {
crit.add(
Restrictions.and(
Restrictions.eq(
"tomaMx.codTipoMx.idTipoMx", Integer.valueOf(filtro.getCodTipoMx()))));
}
// se filtra por area que procesa
/*if (filtro.getIdAreaProcesa()!=null){
crit.createAlias("orden.codExamen", "examen");
crit.add( Restrictions.and(
Restrictions.eq("examen.area.idArea", Integer.valueOf(filtro.getIdAreaProcesa())))
);
}*/
// Se filtra por rango de fecha de recepcion en laboratorio
if (filtro.getFechaInicioRecepLab() != null && filtro.getFechaFinRecepLab() != null) {
crit.add(
Subqueries.propertyIn(
"recepcion.idRecepcion",
DetachedCriteria.forClass(RecepcionMxLab.class)
.createAlias("recepcionMx", "recepcionGral")
.add(
Restrictions.between(
"fechaHoraRecepcion",
filtro.getFechaInicioRecepLab(),
filtro.getFechaFinRecepLab()))
.setProjection(Property.forName("recepcionGral.idRecepcion"))));
}
if (filtro.getIncluirMxInadecuada() != null && filtro.getIncluirMxInadecuada()) {
crit.add(
Restrictions.or(Restrictions.isNull("recepcion.calidadMx.codigo"))
.add(Restrictions.or(Restrictions.ne("recepcion.calidadMx.codigo", "CALIDMX|IDC"))));
}
if (filtro.getCodigoUnicoMx() != null) {
crit.add(
Restrictions.or(Restrictions.eq("tomaMx.codigoUnicoMx", filtro.getCodigoUnicoMx()))
.add(
Restrictions.or(Restrictions.eq("tomaMx.codigoLab", filtro.getCodigoUnicoMx()))));
}
// se filtra por tipo de solicitud
if (filtro.getCodTipoSolicitud() != null) {
if (filtro.getCodTipoSolicitud().equals("Estudio")) {
crit.add(
Subqueries.propertyIn(
"tomaMx.idTomaMx",
DetachedCriteria.forClass(DaSolicitudEstudio.class)
.createAlias("idTomaMx", "toma")
.setProjection(Property.forName("toma.idTomaMx"))));
} else {
crit.add(
Subqueries.propertyIn(
"tomaMx.idTomaMx",
DetachedCriteria.forClass(DaSolicitudDx.class)
.createAlias("idTomaMx", "toma")
.add(
Subqueries.propertyIn(
"labProcesa.codigo",
DetachedCriteria.forClass(AutoridadLaboratorio.class)
.createAlias("laboratorio", "labautorizado")
.createAlias("user", "usuario")
.add(
Restrictions.eq(
"pasivo", false)) // autoridad laboratorio activa
.add(
Restrictions.and(
Restrictions.eq(
"usuario.username",
filtro.getNombreUsuario()))) // usuario
.setProjection(Property.forName("labautorizado.codigo"))))
.setProjection(Property.forName("toma.idTomaMx"))));
}
}
// nombre solicitud
if (filtro.getNombreSolicitud() != null) {
if (filtro.getCodTipoSolicitud() != null) {
if (filtro.getCodTipoSolicitud().equals("Estudio")) {
crit.add(
Subqueries.propertyIn(
"solicitudtomaMx.idTomaMx",
DetachedCriteria.forClass(DaSolicitudEstudio.class)
.createAlias("tipoEstudio", "estudio")
.add(
Restrictions.ilike(
"estudio.nombre", "%" + filtro.getNombreSolicitud() + "%"))
.createAlias("idTomaMx", "toma")
.setProjection(Property.forName("toma.idTomaMx"))));
} else {
crit.add(
Subqueries.propertyIn(
"tomaMx.idTomaMx",
DetachedCriteria.forClass(DaSolicitudDx.class)
.createAlias("codDx", "dx")
.add(Restrictions.ilike("dx.nombre", "%" + filtro.getNombreSolicitud() + "%"))
.createAlias("idTomaMx", "toma")
.setProjection(Property.forName("toma.idTomaMx"))));
}
} else {
Junction conditGroup = Restrictions.disjunction();
conditGroup
.add(
Subqueries.propertyIn(
"tomaMx.idTomaMx",
DetachedCriteria.forClass(DaSolicitudEstudio.class)
.createAlias("tipoEstudio", "estudio")
.add(
Restrictions.ilike(
"estudio.nombre", "%" + filtro.getNombreSolicitud() + "%"))
.createAlias("idTomaMx", "toma")
.setProjection(Property.forName("toma.idTomaMx"))))
.add(
Subqueries.propertyIn(
"tomaMx.idTomaMx",
DetachedCriteria.forClass(DaSolicitudDx.class)
.createAlias("codDx", "dx")
.add(
Restrictions.ilike(
"dx.nombre", "%" + filtro.getNombreSolicitud() + "%"))
.createAlias("idTomaMx", "toma")
.setProjection(Property.forName("toma.idTomaMx"))));
crit.add(conditGroup);
}
}
// se filtra que usuario tenga autorizado laboratorio al que se envio la muestra desde ALERTA
/*if (filtro.getNombreUsuario()!=null) {
crit.createAlias("tomaMx.envio","envioMx");
crit.add(Subqueries.propertyIn("envioMx.laboratorioDestino.codigo", DetachedCriteria.forClass(AutoridadLaboratorio.class)
.createAlias("laboratorio", "labautorizado")
.createAlias("user", "usuario")
.add(Restrictions.eq("pasivo",false)) //autoridad laboratorio activa
.add(Restrictions.and(Restrictions.eq("usuario.username",filtro.getNombreUsuario()))) //usuario
.setProjection(Property.forName("labautorizado.codigo"))));
}*/
if (filtro.getCodEstado() != null) {
if (filtro
.getCodEstado()
.equalsIgnoreCase("ESTDMX|EPLAB")) { // significa que es recepción en laboratorio
// Se filtra que el área a la que pertenece la solicitud este asociada al usuario
// autenticado
Junction conditGroup = Restrictions.disjunction();
conditGroup
.add(
Subqueries.propertyIn(
"tomaMx.idTomaMx",
DetachedCriteria.forClass(DaSolicitudEstudio.class)
.createAlias("tipoEstudio", "estudio")
.createAlias("estudio.area", "area")
.add(
Subqueries.propertyIn(
"area.idArea",
DetachedCriteria.forClass(AutoridadArea.class)
.add(Restrictions.eq("pasivo", false)) // autoridad area activa
.add(
Restrictions.and(
Restrictions.eq(
"user.username",
filtro.getNombreUsuario()))) // usuario
.setProjection(Property.forName("area.idArea"))))
.createAlias("idTomaMx", "toma")
.setProjection(Property.forName("idTomaMx.idTomaMx"))))
.add(
Subqueries.propertyIn(
"tomaMx.idTomaMx",
DetachedCriteria.forClass(DaSolicitudDx.class)
.createAlias("codDx", "dx")
.createAlias("dx.area", "area")
.add(
Subqueries.propertyIn(
"area.idArea",
DetachedCriteria.forClass(AutoridadArea.class)
.add(Restrictions.eq("pasivo", false)) // autoridad area activa
.add(
Restrictions.and(
Restrictions.eq(
"user.username",
filtro.getNombreUsuario()))) // usuario
.setProjection(Property.forName("area.idArea"))))
.createAlias("idTomaMx", "toma")
.setProjection(Property.forName("toma.idTomaMx"))));
crit.add(conditGroup);
}
}
// filtro que las rutinas pertenezcan al laboratorio del usuario que consulta
crit.createAlias("recepcion.labRecepcion", "labRecep");
crit.add(
Subqueries.propertyIn(
"labRecep.codigo",
DetachedCriteria.forClass(AutoridadLaboratorio.class)
.createAlias("laboratorio", "labautorizado")
.createAlias("user", "usuario")
.add(Restrictions.eq("pasivo", false)) // autoridad laboratorio activa
.add(
Restrictions.and(
Restrictions.eq("usuario.username", filtro.getNombreUsuario()))) // usuario
.setProjection(Property.forName("labautorizado.codigo"))));
// sólo la última recepción de cada muestra
DetachedCriteria maxDateQuery = DetachedCriteria.forClass(RecepcionMx.class);
maxDateQuery.createAlias("tomaMx", "mx");
maxDateQuery.add(Restrictions.eqProperty("mx.idTomaMx", "tomaMx.idTomaMx"));
maxDateQuery.setProjection(Projections.max("fechaHoraRecepcion"));
crit.add(Property.forName("fechaHoraRecepcion").eq(maxDateQuery));
// filtro sólo control calidad en el laboratio del usuario
if (filtro.getControlCalidad() != null) {
if (filtro
.getControlCalidad()) { // si hay filtro por control de calidad y es "Si", sólo incluir
// rutinas
crit.add(
Subqueries.propertyIn(
"tomaMx.idTomaMx",
DetachedCriteria.forClass(DaSolicitudDx.class)
.add(Restrictions.eq("controlCalidad", filtro.getControlCalidad()))
.createAlias("idTomaMx", "toma")
.add(
Subqueries.propertyIn(
"labProcesa.codigo",
DetachedCriteria.forClass(AutoridadLaboratorio.class)
.createAlias("laboratorio", "labautorizado")
.createAlias("user", "usuario")
.add(
Restrictions.eq(
"pasivo", false)) // autoridad laboratorio activa
.add(
Restrictions.and(
Restrictions.eq(
"usuario.username",
filtro.getNombreUsuario()))) // usuario
.setProjection(Property.forName("labautorizado.codigo"))))
.setProjection(Property.forName("toma.idTomaMx"))));
} else { // si hay filtro por control de calidad y es "No", siempre incluir los estudios
Junction conditGroup = Restrictions.disjunction();
conditGroup
.add(
Subqueries.propertyIn(
"tomaMx.idTomaMx",
DetachedCriteria.forClass(DaSolicitudDx.class)
.add(Restrictions.eq("controlCalidad", filtro.getControlCalidad()))
.createAlias("idTomaMx", "toma")
.add(
Subqueries.propertyIn(
"labProcesa.codigo",
DetachedCriteria.forClass(AutoridadLaboratorio.class)
.createAlias("laboratorio", "labautorizado")
.createAlias("user", "usuario")
.add(
Restrictions.eq(
"pasivo", false)) // autoridad laboratorio activa
.add(
Restrictions.and(
Restrictions.eq(
"usuario.username",
filtro.getNombreUsuario()))) // usuario
.setProjection(Property.forName("labautorizado.codigo"))))
.setProjection(Property.forName("toma.idTomaMx"))))
.add(
Restrictions.or(
Subqueries.propertyIn(
"tomaMx.idTomaMx",
DetachedCriteria.forClass(DaSolicitudEstudio.class)
.createAlias("idTomaMx", "idTomaMx")
.setProjection(Property.forName("idTomaMx.idTomaMx")))));
crit.add(conditGroup);
}
}
// filtro para sólo solicitudes aprobadas
if (filtro.getSolicitudAprobada() != null) {
Junction conditGroup = Restrictions.disjunction();
conditGroup
.add(
Subqueries.propertyIn(
"tomaMx.idTomaMx",
DetachedCriteria.forClass(DaSolicitudEstudio.class)
.add(Restrictions.eq("aprobada", filtro.getSolicitudAprobada()))
.createAlias("idTomaMx", "toma")
.setProjection(Property.forName("toma.idTomaMx"))))
.add(
Subqueries.propertyIn(
"tomaMx.idTomaMx",
DetachedCriteria.forClass(DaSolicitudDx.class)
.add(Restrictions.eq("aprobada", filtro.getSolicitudAprobada()))
// .add(Restrictions.eq("controlCalidad",false)) ¿¿¿¿¿¿¿¿¿?????????????
.createAlias("idTomaMx", "toma")
.setProjection(Property.forName("toma.idTomaMx"))));
crit.add(conditGroup);
}
return crit.list();
}