public boolean getSpan(int index, MutableSeqSpan span) {
if (index == 0) {
if (forward) {
span.set(txMin, txMax, seq);
} else {
span.set(txMax, txMin, seq);
}
return true;
} else {
return false;
}
}
public boolean getSpan(BioSeq bs, MutableSeqSpan span) {
if (bs.equals(this.seq)) {
if (forward) {
span.set(txMin, txMax, seq);
} else {
span.set(txMax, txMin, seq);
}
return true;
} else {
return false;
}
}