/** Creates the total selector's set for get all the possible rules */ private Complejo hazSelectores(Dataset train) { Complejo almacenSelectores; int nClases = train.getnclases(); almacenSelectores = new Complejo(nClases); // Aqui voy a almacenar los selectores (numVariable,operador,valor) Attribute[] atributos = null; int num_atributos, type; Vector nominalValues; atributos = Attributes.getAttributes(); num_atributos = Attributes.getNumAttributes(); Selector s; for (int i = 0; i < train.getnentradas(); i++) { type = atributos[i].getType(); switch (type) { case 0: // NOMINAL nominalValues = atributos[i].getNominalValuesList(); // System.out.print("{"); for (int j = 0; j < nominalValues.size(); j++) { // System.out.print ((String)nominalValues.elementAt(j)+" "); s = new Selector(i, 0, (String) nominalValues.elementAt(j), true); // [atr,op,valor] // incluimos tb los valores en double para facilitar algunas funciones s.setValor((double) j); almacenSelectores.addSelector(s); // s.print(); } // System.out.println("}"); break; } // System.out.println(num_atributos); } return almacenSelectores; }
/** Returns True if the rule is perfect for the data set. */ public boolean perfectRule(Complejo regla, Dataset train) { ConjDatos datosTrain; datosTrain = new ConjDatos(); datosTrain = creaConjunto(train); boolean perfecta = false; /*Muestra m = datosTrain.getDato(3);//la primera instancia basicamente System.out.println(m.getClase());*/ Muestra m; ConjDatos cubiertas; cubiertas = new ConjDatos(); /*todas las instancias que cubra la regla las metemos en un conjunto*/ for (int i = 0; i < train.getndatos(); i++) { m = datosTrain.getDato(i); if (regla.cubre(m)) { cubiertas.addDato(m); } } /*perfecta sera true si todos los ejemplos del conjunto 'cubiertas' tienen la misma clase que predice la regla*/ for (int i = 0; i < cubiertas.size(); i++) { if (cubiertas.getDato(i).getClase() != regla.getClase()) { perfecta = false; return perfecta; } else perfecta = true; } return perfecta; }
/** * Constructor to copy all the attributes of another dataset but the itemsets. * * @param dataset The dataset to be copied. * @param capacity The number of itemsets. */ public Dataset(Dataset dataset, int capacity) { if (capacity < 0) capacity = 0; classIndex = dataset.classIndex; name = dataset.getName(); attributes = dataset.attributes; itemsets = new Vector(capacity); }
/** Calculates the necessary statistical data and creates KEEL out-put files */ private void generaSalida() { Fichero f = new Fichero(); String cad = ""; String miSalida = new String(""); miSalida = train.copiaCabeceraTest(); // System.out.println("\n Estas son las reglas encontradas:"); // conjReglasFinal.print(); conjunto_reglas.adjuntaNombreClases(clases); conjunto_reglas.adjuntaNombreClase(nombre_atributos[train.getnentradas()]); cad = conjunto_reglas.printString(); /*cad += "\n\n" + evReg.printString() + "\n\n Time (seconds); " + (tiempo / 1000);*/ f.escribeFichero(ficheroSalida, cad); f.escribeFichero(ficheroSalidaTr, miSalida + evReg.salida(datosTrain)); f.escribeFichero(ficheroSalidaTst, miSalida + evReg.salida(datosTest)); }
/** * Creates a set of data(attribute/class) * * @param mis_datos Must be a set of data readen from the file (see doc Dataset.java) * @return The set of data created, a list of examples (see ConjDatos.java and Muestra.java) */ private ConjDatos creaConjunto(Dataset mis_datos) { ConjDatos datos = new ConjDatos(); // Creo un nuevo conjunto de datos int tam = mis_datos .getnentradas(); // Pillo el nmero de atributos de entrada (suponemos una sola salida // [clase]) double[] vars = new double [tam]; // Creamos el vector que guardar�los valores de los atributos (aun siendo // enteros o enum) double[][] X; int[] C; int clase = 0; // Variable que contendr�el valor para la clase X = mis_datos.getX(); C = mis_datos.getC(); for (int i = 0; i < mis_datos.getndatos(); i++) { // System.out.print("\n"+i+":"); for (int j = 0; (j < tam); j++) { // System.out.print(" "+X[i][j]); if (mis_datos.isMissing(i, j)) { vars[j] = mis_datos.masComun(j); } else { // CAMBIAR POR OTROS METODOS DE MANEJO DE VALORES PERDIDOS (15-NN). vars[j] = X[i][ j]; // Double.parseDouble(mis_datos.getDatosIndex(i, j)); //pillo el valor del // atributo j para el ejemplo i } } // if (!salir) { clase = C[i]; // Integer.parseInt(mis_datos.getDatosIndex(i, tam)); Muestra m = new Muestra( vars, clase, tam); // Creo un nuevo dato del conjunto con sus variables, su clase y el num // variables m.setPosFile(i); datos.addDato(m); // } } return datos; }
/** * Constructor with all the attributes to initialize * * @param ficheroTrain Train file * @param ficheroTest Test file * @param fSalidaTr Out-put train file * @param fSalidaTst Out-put test file * @param fsalida Out-put file * @param semilla seed */ public Prism( String ficheroTrain, String ficheroTest, String fSalidaTr, String fSalidaTst, String fsalida, long semilla) { ficheroSalida = fsalida; ficheroSalidaTr = fSalidaTr; ficheroSalidaTst = fSalidaTst; seed = semilla; datosTrain = new ConjDatos(); // datosEval = new ConjDatos(); datosTest = new ConjDatos(); train = new Dataset(); test = new Dataset(); s = new Selector(0, 0, 0.); conjunto_reglas = new ConjReglas(); try { Randomize.setSeed(seed); System.out.println("la semilla es " + seed); train.leeConjunto(ficheroTrain, true); test.leeConjunto(ficheroTest, false); // if (train.hayAtributosContinuos() /*|| train.hayAtributosDiscretos()*/) { System.err.println("\nPrism may not work properly with real or integer attributes.\n"); // System.exit(-1); hayContinuos = true; } if (!hayContinuos) { train.calculaMasComunes(); // eval.calculaMasComunes(); test.calculaMasComunes(); datosTrain = creaConjunto( train); // Leemos los datos de entrenamiento (todos seguidos como un // String)//datosEval = creaConjunto(eval); datosTest = creaConjunto(test); valores = train.getX2(); // obtengo los valores nominales clases = train.getC2(); clasitas = train.getC(); /*System.out.println(train.getndatos()); System.out.println(train.getnentradas()); for(int i=0;i<train.getndatos();i++){ for(int j=0;j<train.getnentradas();j++) System.out.print(valores[i][j]); System.out.print(clases[i]);System.out.println(clasitas[i]);}*/ // COMENZAMOS EL ALGORITMO PRISM // FOR EACH CLASS C clases = train.dameClases(); int unavez = 0, candidato; for (int i = 0; i < train.getnclases(); i++) { System.out.println("CLASE :" + clases[i] + "\n"); // initialize E to the instance set /*Cuando haya que inicializar de nuevo el conjunto de instancias no es necesario insertar aquellas que se eliminaron, sino que nos va a bastar con inicializar otra vez el conjunto mediante el fichero de entrenamiento. Por eso hay un metodo para insertar una instancia*/ train.leeConjunto(ficheroTrain, false); nombre_atributos = train.dameNombres(); instancias = train.getInstanceSet(); // While E contains instances in class C while (train.hayInstanciasDeClaseC(i)) { // Create a rule R with an empty left-hand side that predicts class C regla = new Complejo(train.getnclases()); regla.setClase(i); regla.adjuntaNombreAtributos(nombre_atributos); // esto lo hacemos solo aqui pq luego vamos quitando selectores del almacen almacen = hazSelectores(train); almacen.adjuntaNombreAtributos(nombre_atributos); do { // FOR EACH ATTRIBUTE A NOT MENTIONED IN R, AND EACH VALUE V accuracy_ant = -1.; p = 0; int seleccionados[] = new int[almacen.size()]; for (int jj = 0; jj < almacen.size(); jj++) seleccionados[jj] = 0; System.out.println(); for (int j = 0; j < almacen.size(); j++) { // tenemos que quitar el selector anterior if (j > 0) regla.removeSelector(s); s = almacen.getSelector(j); // if(i==0) s.print(); // CONSIDER ADDING THE CONDITION A=V TO THE LHS OF R regla.addSelector(s); accuracy = getAccuracy(i); // if(i==0) { System.out.println("correctas " + num_correctas + " cubiertas " + num_cubiertas); System.out.println("Acurracy " + accuracy); // } if ((accuracy > accuracy_ant) || ((accuracy == accuracy_ant) && (num_correctas > p))) { // if((accuracy==accuracy_ant) &&(num_correctas>p)){ // System.out.println("atn "+accuracy_ant); // System.out.println("ahora "+accuracy); accuracy_ant = accuracy; seleccionado = j; p = num_correctas; // si se encuentra un superior hay que quitar // todo lo q se hay ido almacenando en esta iteracion for (int jj = 0; jj < almacen.size(); jj++) seleccionados[jj] = 0; // } } else { if ((accuracy == accuracy_ant) && (num_correctas == p)) { seleccionados[seleccionado] = 1; seleccionados[j] = 1; } } } // seleccionamos uno de los seleccionados en el caso de empate int contador = 0; for (int jj = 0; jj < almacen.size(); jj++) { if (seleccionados[jj] == 1) { contador++; System.out.println("OPCION " + jj); } } if (contador > 0) { candidato = Randomize.RandintClosed(1, contador); contador = 0; for (int jj = 0; jj < almacen.size(); jj++) { if (seleccionados[jj] == 1) { contador++; if (contador == candidato) seleccionado = jj; } } } System.out.println("ELEGIDO " + seleccionado); // antes hay que quitar el q metimos regla.removeSelector(s); s = almacen.getSelector(seleccionado); s.print(); // ADD A=V TO R regla.addSelector(s); /*AHORA HAY QUE QUITAR DEL ALMACEN SE SELECTORES AQUELLOS QUE HACEN REFERENCIA AL ATRIBUTO SELECCIONADO*/ // obtener el atributo del selector ganador atributo = s.getAtributo(); // se borran todos los q tengan ese atributo // System.out.println("ALMACEN");almacen.print(); almacen.removeSelectorAtributo(atributo); reglaPerfecta = perfectRule(regla, train); } while (!reglaPerfecta && (regla.size() < train.getnentradas())); System.out.println("\n"); System.out.println("\nREGLA............................................"); regla.print(); System.out.println("\n"); /*necesitamos evaluar la regla para obtener la salida del metodo para compararla con la salida esperada*/ evaluarComplejo(regla, datosTrain); // INCLUIMOS ESTA REGLA YA PARA EL CONJUNTO FINAL DE REGLAS conjunto_reglas.addRegla(regla); // REMOVE THE INSTANCES COVERED BY R FROM E // Instance instancia; /*for(int k=0;k<instancias.getNumInstances();k++){ instancia=instancias.getInstance(k); System.out.print(k+" "); instancia.print(); System.out.println(); }*/ removeInstancesCovered(i); for (int k = 0; k < instancias.getNumInstances(); k++) { instancia = instancias.getInstance(k); clase = instancia.getOutputNominalValuesInt(0); if (clase == i) { System.out.print(k + " "); instancia.print(); System.out.println(); } } // instancias.print(); System.out.println("\n"); } // del while } // del for de las clases // EVALUAMOS LA CALIDAD DE LAS REGLAS int[] clasesEval; clasesEval = train.getC(); muestPorClaseEval = new int[train.getnclases()]; for (int j = 0; j < train.getnclases(); j++) { muestPorClaseEval[j] = 0; for (int i = 0; i < datosTrain.size(); i++) { if ( /*valorClases[j]*/ j == clasesEval[i]) { muestPorClaseEval[j]++; } } } conjunto_reglas.eliminaRepetidos(1); evReg = new EvaluaCalidadReglas( conjunto_reglas, datosTrain, datosTest, muestPorClaseEval, muestPorClaseEval, clases); // GENERAMOS LA SALIDA generaSalida(); System.out.println("la semilla es " + seed); } // del if } catch (IOException e) { System.err.println("There was a problem while trying to read the dataset files:"); System.err.println("-> " + e); // System.exit(0); } }
/** * Constructor that copies another dataset. * * @param dataset The dataset to be copied. */ public Dataset(Dataset dataset) { this(dataset, dataset.numItemsets()); dataset.copyItemsets(0, this, dataset.numItemsets()); }
/** * Function to add the instances of one set to the end of another. * * @param from The index of the first that is going to be copied. * @param dest The dataset where the itemsets are going to be copied. * @param num The number of itemsets to copy. */ private void copyItemsets(int from, Dataset dest, int num) { for (int i = 0; i < num; i++) dest.addItemset(itemset(from + i)); }