public boolean getSpan(int index, MutableSeqSpan span) {
   if (index == 0) {
     if (forward) {
       span.set(txMin, txMax, seq);
     } else {
       span.set(txMax, txMin, seq);
     }
     return true;
   } else {
     return false;
   }
 }
 public boolean getSpan(BioSeq bs, MutableSeqSpan span) {
   if (bs.equals(this.seq)) {
     if (forward) {
       span.set(txMin, txMax, seq);
     } else {
       span.set(txMax, txMin, seq);
     }
     return true;
   } else {
     return false;
   }
 }