public PDBChain findChain(String id) {
for (int i = 0; i < chains.size(); i++) {
// System.out.println("ID = " + id + " " +((PDBChain)chains.elementAt(i)).id);
if (((PDBChain) chains.elementAt(i)).id.equals(id)) {
return (PDBChain) chains.elementAt(i);
}
}
return null;
}
public void setChainColours() {
for (int i = 0; i < chains.size(); i++) {
((PDBChain) chains.elementAt(i)).setChainColours();
}
}
public void makeCaBondList() {
for (int i = 0; i < chains.size(); i++) {
((PDBChain) chains.elementAt(i)).makeCaBondList();
}
}