Ejemplos de AbstractSequence.getLength en Java

Ejemplo n.º 1

Archivo: GenericTool.java Proyecto: vagnerfonseca/rega-genotype

 private AbstractSequence cutRegion(
     AbstractSequence s, BlastAnalysis.Result blastResult, BlastAnalysis.Region region) {
   int rs = Math.max(0, region.getBegin() - blastResult.getStart());
   int re = Math.min(s.getLength(), s.getLength() - (blastResult.getEnd() - region.getEnd()));
   AbstractSequence s2 = re > rs ? new SubSequence(s.getName(), s.getDescription(), s, rs, re) : s;
   return s2;
 }